Ornitil ajuda a transformar produtos tóxicos, decorrentes da metabolização de proteínas, em substâncias menos tóxicas, passíveis de serem excretadas ou reaproveitadas. o principal metabólito produzido por estas reações é a amônia, que deve ser transformada em ureia, pelo ciclo da uréia ou de krebs-henseleit. durante o ciclo, a participação da ornitina, citrulina e arginina são fundamentais para a transformação da amônia e eliminação da uréia.